Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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