Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNW1Q13573 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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