Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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