Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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