Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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