Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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