Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms