Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NRG1Q02297 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms