Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
IFITM3Q01628 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
IFITM3Q01628 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms