Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVFC1-1P60608 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms