Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms