Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHB1P54762 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHB1P54762 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms