Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTAP49354 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FNTAP49354 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms