Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC4A3P48751 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms