Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms