Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms