Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASP1P29466 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASP1P29466 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms