Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HTR2AP28223 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms