Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHMLP26374 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHMLP26374 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHMLP26374 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHMLP26374 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHMLP26374 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms