Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms