Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDCP19113 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDCP19113 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDCP19113 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDCP19113 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDCP19113 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDCP19113 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDCP19113 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDCP19113 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDCP19113 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDCP19113 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDCP19113 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDCP19113 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDCP19113 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDCP19113 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDCP19113 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDCP19113 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDCP19113 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDCP19113 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDCP19113 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDCP19113 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDCP19113 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms