Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP2AP11388 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP2AP11388 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms