Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms