Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PGA3P0DJD8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms