Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms