Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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