Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMP1P01033 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms