Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINC1P01008 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms