Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SCN2BO60939 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SCN2BO60939 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SCN2BO60939 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SCN2BO60939 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SCN2BO60939 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SCN2BO60939 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SCN2BO60939 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SCN2BO60939 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SCN2BO60939 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCN2BO60939 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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