Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP104O60308 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP104O60308 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP104O60308 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP104O60308 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP104O60308 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP104O60308 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP104O60308 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP104O60308 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEP104O60308 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP104O60308 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms