Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HOXA2O43364 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HOXA2O43364 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HOXA2O43364 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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HOXA2O43364 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HOXA2O43364 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HOXA2O43364 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HOXA2O43364 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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HOXA2O43364 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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