Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNN4O15554 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNN4O15554 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNN4O15554 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms