Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RHBDD3Q9Y3P4 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms