Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFR3BQ9Y2G0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFR3BQ9Y2G0 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 326.2 ms