Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF24Q9UPV7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms