Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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COPS7AQ9UBW8 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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COPS7AQ9UBW8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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COPS7AQ9UBW8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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COPS7AQ9UBW8 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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COPS7AQ9UBW8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS7AQ9UBW8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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