Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TBCCD1Q9NVR7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms