Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRHQ9HD43 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms