Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms