Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
KATNB1Q9BVA0 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KATNB1Q9BVA0 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KATNB1Q9BVA0 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KATNB1Q9BVA0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KATNB1Q9BVA0 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KATNB1Q9BVA0 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KATNB1Q9BVA0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KATNB1Q9BVA0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KATNB1Q9BVA0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KATNB1Q9BVA0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KATNB1Q9BVA0 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KATNB1Q9BVA0 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms