Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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