Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms