Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SEMA3CQ99985 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SEMA3CQ99985 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SEMA3CQ99985 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SEMA3CQ99985 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SEMA3CQ99985 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA3CQ99985 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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