Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN18Q99952 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms