Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms