Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms