Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPRD1AQ96P16 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPRD1AQ96P16 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms