Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms