Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ECHDC3Q96DC8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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