Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms